Teď, když jsou vaše karty uspořádané podle sady, můžete je vložit do úložného kontejneru a dokončit tak organizaci.
Pokud používáte pořadač, ujistěte se, že sloty pro karty jsou dostatečně velké pro vaše karty Pokémonů. Některé pořadače karet jsou určeny pro menší karty a pokus o umístění karet Pokémonů do nich může způsobit ohnutí nebo jinou deformaci karet. Při organizování karet podle sady důvěřujte nastaveným symbolům a číslům, i když se Pokémoni na kartě zdají být stejní. Charizard ze sady PYP a Charizard ze sady Power Keepers mají různá čísla, obrázky a schopnosti.